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基于Super-BSA技術對漢麻纖維含量相關基因的挖掘
2021-06-17 11:29:10

项目名称:基于Super-BSA技術對漢麻纖維含量相關基因的挖掘

項目級別:省科學院院青年創新基金面上項目

起止時間:2019.01-2020.12

項目介紹:項目采用簡化基因組深度測序技術(SLAF-seq)對樣本進行高通量測序,開發出了368,404個SLAF標簽。挖掘出了6個漢麻纖維含量相關基因,爲高纖維含量漢麻遺傳改良提供了理論基礎和基因材料。

1 SLAF標簽(黑色線)在漢麻染色體上的分布

Fig1. The distribution diagrams of all SLAFs (black lines)on Cannabis sativa genome





2 SNP-index關聯值在染色體上的分布

Fig2. Distribution of SNP-index correlation values on chromosomes注:橫坐標爲染色體名稱,彩色的點代表計算出來的SNP-index(或ΔSNP-index)值,黑色的線爲擬合後的SNP-index(或ΔSNP-index)值。上圖是隐性混池的SNP-index值的分布圖;中圖是显性混池的SNP-index值的分布圖;下圖是ΔSNP-index值的分布圖,其中红色的线代表99百分位數的阈值線。


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